Ну что тут можно сказать. Оба мэйкфайла к осмотру.
А скомпилить можно и без них типа
Цитата
avr-gcc -c -mmcu=atmega162 -Os -std=c99 main.c -o main.o
А потом слинковать.
Цитата
avr-gcc -mmcu=atmega162 -adhlns=main.o -std=c99 -main.o --output main.elf -lm
В ключиках не уверен, вырезал лишнее, мог переборщить, но в любом случае их можно глянуть в доке.
И еще - я не зря спросил про студию - в ней путь к либам, может быть указан дважды.Типа в системных установках и установках проекта (Точно не знаю, секс со старыми версиями в корне отбил желание работать с этой связкой)