Как я понял из поста "Вызов функции по указателю на функцию., Переполнение стека AVR Simulator: Stack Underflow at 0x01f3." AVRStudio выдаёт неправильное сообщение. В моём случае сообщение возникает тоже при вызове функции по указателю. Т.е. на этот счёт можно не беспокоится.