Извините за не понимание НО при чем тут 125 микросекунд....
Приложение вызывает метод библиотеки передает ему буфер данных, метод выполняет кодирование и возвращает буфер в главную программу.
Планировалось все делать в одном потоке....
Проблема не с Linux и не с потоками.
Проблема в Intel IPP ибо простиньких примеров в сети найти я не могу