Судя по даташиту, в режиме совместимости регистры и расположение битов становятся такими же, как в классике. Т.е. TCCR1B = 0x0D - таймер1 работает в режиме normal. Но тогда странно, что 3 сек. превратились в 12, а не в 16. С другой стороны, может таймер работает как надо, а проц с какого-то перепугу от внутренней 1МГц? Это легко проверить каким-нибудь _delay_ms, отключив прерывания.
|