Т.е. лучше всего будет взять 2 МК, каждый на свою ось ,и соединить их по какому-то интерфейсу?
Но ведь каждый контроллер должен знать координаты как Х так и У, т.к. линия от (x1,y1) к (x2,y2) должна быть ровной. Т.е. нельзя сначала переместить по х, а потом по у. Нужно одновременно, и каждый контроллер должен знать как показания датчиков обратной связи своего двигателя, так и второго.
Лучше бы одним МК это все делать, наверное, но пока не нашел для 2 двигателей