Все обстоит именно так как Вы и описали.
Или через Renumber или через Properties.
Вручную очень неудобно даже просто поменять местами позиционные обозначения. Нужно сначала освободить одно из позиционных обозначений переименовав его.
В вашем случае выход ввести отличные от остальных позиционные обозначения в функциональных блоках ,тогда авторенумбер прокатит.
Или остается ... вручную через свойства.
Я по началу тоже с этим заморачивался...последовательная нумерация хороша только на схеме, а вы посмотрите потом на спецификацию