Пишу превый отчет об решении вопросов по теме.

1. Установил Debian x86, к сожалению пока не x86_64 (тут кстати вопрос у меня проц Intel Core 2 на него x86_64 нужен? Для работы с 64 битами?).
2. Установил matlab r14 заработал не сразу! Снова глючили самописные s-функции.
Ошибка:
Unable to load mex file: /bit_gen.mexglx.
/usr/local/matlab/bin/glnx86/../../sys/os/glnx86/libgcc_s.so.1: version
`GCC_3.3' not found (required by /usr/lib/libstdc++.so.6)
??? Invalid MEX-file 'bit_gen.mexglx': .
Исправил так:
cd $matlab/sys/os/glnx86
mkdir old
mv libg2c.so.0 old
mv libg2c.so.0.0.0 old
mv libgcc_s.so.1 old
3. matlab устанавливал в двух версиях х86 и х86_64, работают обе, но грузят все равно одно ядро процессора

. Возможно нужен линукс х86_64, это буду проверять!
4. Пытался заставить CCS работать под Wine и Crossover! Не работает...

. VirtualBox - вариант! Но пока не опробовал только установил. Сначала нужно чтоб matlab начал работать так как нужно...