Сергей правду говорит. Если вы ECO формируете через NetSync , естественно в результате сравнеияя и почвляются команды удаления. И это последовательность есть не что иное как ввод netlists на плату Либо поставте на схему пустой элемент с корпусом радиатора, либо удалите ссответствующие строки из ECO- файла, или не делайте вообще таким образом ECO