Цитата
пользовались QualeCAD View3D, или только родным
Родного вполне хватает. Тем более правила распоратраняются только на Component Body а не на размеры 3D модели.
Цитата
QualeCAD-овский просмотрщик будет искать файлы моделей не с именем Footprint, как он это делает по умолчанию, а с именем <ModelName> если в свойствах PCB компонента в поле Footprint Description задано это <ModelName>
А не прощели QualeCAD-овский просмотрщик настроить на параметр Comment, а последнему присвоить имя трехмерной модели?