Мы тоже использовали эти процы, но нам еще год назад сказали, что их сняли с производства и сейчас выгребают все с различных складов. Так что у вас может быть некондиция, потому что слишком большой процент перезаписей. Посмотри ERRATу
http://atmel.com/dyn/resources/prod_documents/DOC1963.PDF - это так, для информации.
Рекомендации:
1.Можно увеличить емкость конденсаторов по сбросу, чтобы проц начал работу, когда напряжение полностью стабилизируется.
2.Записывать программу по адресу отличному от 0Х00.
3.Сделать в начале программы задержку.
4.Считать контрольные суммы программы и EEPROM. Делать копии параметров хранящихся в EEPROM и, в случае ошибки контрольной суммы одной из копий, использовать копию без ошибки.
5.А вообще нужен супервизор, хотя судя по DOC1963.PDF в определенных ситуациях он тоже не поможет.