BootLoader, Newbee наступает с вопросами! Опции

[Злодей]

Здравствуйте, ребята!

Написал бутлоадер, написал пользовательскую программу. Оба в WinAVR. Есть в результате два .elf (ну или просто два сишника с main), теперь надо их соединить, да ещё так, чтоб бутлоадер попадал в "Boot Loader Flash Section".
Направьте меня, в какую сторону копать. Есть ли что-то в MakeFile's, что должно быть подправлено?

Ещё есть несколько конкретных впросов:

В даташите на мегу уделено много внимания "Read-While-Write Section" и "No Read-While-Write Section", я не очень с ними разобрался, вообще это важно?

Я сомниваюсь при выборе алгоритма обновления прошивки, сейчас в голове такая картина:
1. Пользовательская программа, решив обновиться, произносит заклинание asm{ jmp $3F00 }, где - $3F00 - Boot Loader Flash Section. (хоть это я правильно понял? Начнёт работать бутлоадер?)
2. Бутлоадер обновляет флэш и делает asm{ jmp $02A }, запуская тем самым пользовательскую программу (или она не там?)
Но почему-то хочется сделать всё через перезагрузку, вроде:
1. пользовательская программа ставит в EEPROM флаг "обновиться" и перезагружает МК
2. бутлоадер видит флаг, обновляет, снимает флаг, перезагружает МК
3. бутлоадер видит - флага нет, и запускает пользовательскую программу.
Но есть ли в этом смысл, и будет ли разница между была перезагрузка - не было?

Помогите, пожалуйста, у меня очень большое желание сделать красиво :)

Спасибо!

[Dog Pawlowa]

1. Пользовательская программа, решив обновиться, произносит заклинание asm{ jmp $3F00 }, где - $3F00 - Boot Loader Flash Section. (хоть это я правильно понял? ...

Не совсем. Ставите фьюз перехода на бут после сброса и контроллер будет туда переходить по сбросу. Соответственно приложение должно сбрасывать контроллер.
Все остальное тоже не до конца продумано. Обычно бутлоадер должен быть автономным от приложения, т.к. если во время перезаписи флэш выключится питание, вся система может рухнуть.