Вам поможет
ADIsimPLL от Analog Devices
У них богатый выбор Differential Input Active Filters и очень гибкая PLL configuration-
можно ввести параметры практически любого операционника и используемой Вами PLL IC,
ну и задать, собственно, конфигурацию ФАПЧ.
На адекватность результатов TimeDomain & FreqDomain симуляции у меня жалоб нет.
Рекомендую.
Удачи
Эскизы прикрепленных изображений