Все правильно, согласно данному распределению переходов, имена слоя 1,2,5,6 становятся не редактируемы т.к. используются в описании переходов - видимо некая защита от возможных проблем возникающих при переименовании.
Можете например удалить все переходы оставив только 5-6 и верхний слой станет редактируемым тоже, но к сожалению система не даст применить его новое имя, т.к. где то тоже зафиксировано применение именно SIGNAL_1 - она считает что вы пытаетесь добавить металлический слой выше верхнего

.