Идея интересная.
Только есть несколько НО:
1) С ниосом не работал, следовательно, много времени на усвоение уйдёт.
2) Сомнения в скорострельности. Меньше 100 МГц, если ещё повесить остальные задачи может не потянуть (cyclon, cyclonII)
3) Возможность использовать NIOS в Xilinx. Удалось ли кому-нить декриптнуть исходники ниоса и прикрутить их к ксалинксу? Есть подводные камни?