С точки зрения надежности - переходные отверстия надо открывать от маски, и тогда они заливаются ПОС-ом - выше и механическая прочность соединения (площадка-столбик-площадка), и электрическая надежность (увеличивается допустимый ток, не будет разрывов металлизации на переходе площадка-столбик). Увеличивается ремонтопригодность платы. При этом зазор между ПО и площадками должен быть достаточным для перешейка маски (сам перешеек 0.25 + два зазора по 0.1 = 0.45 мм).
А закрытые маской ПО требуют идеального изготовления ПП, что не всегда соответствует практике (прокол или разрыв маски над отверстием приведут к попаданию в отверстие щелочей при изготовлении платы, флюсов при отмывке, что приводит к окислению меди в отверстии, увеличении сопротивления и т.д.).

Не поняла про вероятность закорачивания - это плохое изготовление ? или брак при пайке ?