В апнотах посмотрел, но осталось много вопросов (голого примера прерывания не нашел). Еще хотел бы еще разобраться с программируемым контроллером клоков.
На нашем форуме неоднократно этот вопрос самым подробным образом рассматривался. Что вам не понятно? Какой конкретный пример вы желаете видеть? Чем не устраивают примеры, приведенные Atmel'ом в своих многочисленных примерах? Конкретизируйте!