То, что преобразование требует некоторого колличества тактов, уже само за себя говорит о том, что там не R-2R матрица. И на блок-схеме нарисовано типичное АЦП последовательного приближения. А это означает, что с каждым тактом АЦП вичисляет по одному биту результа. И на каждом такте идет сравнение сигнала с УВХ с сигналом ЦАПа. И в это время нельзя трогать ни reference selection (которое есть опорой цля ЦАПа), ни открывать УВХ (которое
должно быть отключено от внешнего мира). Что и подтверждается приведенной Вами цитатой.
А вот зачем нужна емкость на выходе мультиплексора - хоть убейте, не пойму. Тем более, что выбор канала мультиплексора заблокирован и изменить его можно будет только за 1 такт АЦП до окончания преобразования.
Цитата
При 10 ком, рекомендованых Атмелями, либо надо тормозить АЦП неимоверно, либо удивлятся результатами измерения.
Измеряли при постоянном уровне напряжения на каналах?
На мой взгляд (и мат. расчеты подтверждают), что разницы между 1 и 10 кОм при входном сопротивлении УВХ даже в 100 кОм вообще быть не должно (0,5МЗР).