Отличие результатов работы при загрузке по JTAG и из конф. микросхемы Опции

[Ethereal]

Здравствуйте. Столкнулся тут с такой ситуацией в тестовом проекте.
Микросхема Stratix II. Проект с преобразованием Фурье от данных с АЦП. Результаты выдаются из ПЛИС наружу.
При загрузке прошивки в ПЛИС через программатор на выходе получается один результат обработки.
Если сделать pof (fast passive parallel + сжатие), то результаты после перезагрузки получаются другими. Похожими, но отличающимися в достаточной степени, чтобы это нельзя было списать на шумы или случайность процесса.
Перед ПЛИС стоят АЦП и усилитель.

С чем это может быть связано?

[Koluchiy]

А как сделан ресет всей конструкции?

[slawikg]

А как сделан ресет всей конструкции?

Немного опоздал, разные условия включения питания. При загрузки с усб, питание уже устаканилось, а во втором случае питание только включается. Наверняка у вас несколько питаний. Лечение уже предложили - хороший сброс.