Цитата
Я в своём проекте правил только vhdl файл, описывающий PLL
Я использовал отдельный PLL, так удобней.
Цитата
Может быть вы ещё что нибудь правили? ucf файл например?
ucf правил, цифры берутся из отдельно созданного проекта на 200 МГц.
Начиная с MIG 3.1 констрейнты для Virtex-5 упростили: расположение fabric flip-flops в read capture path основано на атрибутах XIL_PAR_SKEW и XIL_PAR_DELAY, встроенных в vhdl-код. Я их нашел в ddr2_phy_dq_iob.vhd и сравнил с теми же у проекта на 200 МГц, они совпадали.
Еще не забудьте поставить соответствующее значение параметра CLK_PERIOD.