Неадекватное восприятие однако реальности.
Как вы себе представляете перенос проекта из MATLAB-а в QNX?
dll-ку или exe-шник думаете скопировать?
Вариант у вас только один только - получить из matlab-а полные исходники вашего проекта с заглушками для уровня абстракции от хардваре.
Тут проблемы во всем.
Во первых исходники всего в матлабе получить невозможно есть только подмножество примитивных алгоритмов для которых можно получить исходники.
Во вторых уровень абстракции хардваре в QNX кардинально отличается от уровня абстракции под Windows.
Значит кардинально придется перепахивать те немногие добытые тексты.
Далее придется их запускать заново откомпилированные на QNX и заново делать профайлинг. При этом не забыть что работаете совершенно на другом уровне хардваре с неизвестным быстродействием.
Никакие фичи риалтайма QNX здесь не помогут поскольку в модели MATLAB их использование не предусмотрено.
Т.е. QNX будет работать по отношению к модели точно так же как Windows XP если не хуже поскольку драйвера MATLAB-а под Win XP все таки оптимизируют, а такой операционки как QNX MATLAB не знает.
Я бы помотрел на LabView с пакетом для embedded. Там среда сразу компилит под ARM и может делать профайлинг на целевой платформе.
Поскольку весь софт для вас черный ящик то единственным гарантом риалтайма является не чудесная операционка, а результаты профайлинга и ничего больше.