Похожую проблему имел с AT45DB161 и MSP430F149. Оказалось, что в отличие от Atmel (и многих других) названия (индекс) режимов SPI у MSP430 отличаются - конкретно попутаны. В результате при танцах с бубнами работало, а в более спокойной обстановке

нет. Проверить возможность такого психоза рекомендую