Цитата
подскажите-как посмотреть в ней стек вызовов функций.
Никак.
Можно посмотреть состояние SP, X, Y и Z.
Цитата
постоянно вызывется обработчик прерывания от таймера, при каждом шаге при пошаговой отладке. как его временно отрубить?
Сбросить бит I в SREG или остановить таймер (или настроить прерывания пореже).