Цитата
Synplify знает куда какой gtxe ставить и видно в edf файле, что gtxe ставится на конкретное место
Бррр...
Откуда Synplify знает, куда его ставить? Вы пишете для него констрейны размещения?
Вообще, по моей практике, "непонятно откуда" берущиеся констрейны обычно берутся из 2-х источников:
1) Файл synplify.ucf, если он не пустой и если не отключить его подсоединение к проекту.
2) Другие ucf и прочие файлы, которые каким-то образом подключились к проекту (но у меня такого давно не было).