Когда то давно встречал что-то похожее (очень индусская система попалась, нужно было много констрейнить),
обходил через
Код
NET "i_pll_trib_77_clk" CLOCK_DEDICATED_ROUTE = FALSE;
Убирает ошибку при неоптимальном роуте для клоковых цепей, но там при неоптимально роуте другие качели выскакивали (которые лечил другими колдунствами

)...