В Аллегро(который не только РСВ, а пакет, а точнее связка Design Entry HDL - Variant Manager - PCB Editor) это реализовано через атрибуты, аннотацию схемы этими атрибутами, генерацию соответствующих отчетов и аннотацию вариантов ассембли на РСВ. Но только вариантов ассембли, варианты меди и остальных ключевых элементов дизайна не существуют.
Вы как-то странно представляете себе варианты... Установкой "резисторов" в "точке" занимается человек. И на схему этот "резистор" тоже закладывает человек. И ограничения для установки "резисторов" тоже человек устанавливает. Или Вы хотели чтобы программа сама определяла в каком случае что можно поставить в какой точке?

А если совсем строго рассуждать, то дизайн должен быть рассчитан на худший случай - если в точке А ограничена высота компонента, то она ограничена. И ни один вариант не должен включать в себя компонент в этом месте, нарушающий ограничения. Ибо чревато...