А ОЗУ у этого контроллера всего 4К, как раз на два массива int-ов по 1024 элемента в каждом хватит.
И всё, память кончилась, даже на счётчик цикла не остаётся.

В этом семействе есть ещё модели с 8 килобайтами, может быть в них и можно будет упихать.
Или придумывать алгоритмы менее требовательные к памяти.
Russia est omnis divisa in partes octo.