В принципе задача то одна да только реализация разная ибо FPGA System Planer делает только половину того что делает IOD.
Посмотрите например
demo_video или
презентациюРазница например в том что IOD считывает реальное размещение\трассировку из файла топологии (кстати можно и из Allegro). И делает оптимизацию исходя из текущего размещения. Т.е. работает со всеми реальными компонентами схемы-топологии, а не просто системным уровнем как конкурент и т.д.