Как правильно писать в регистр Опции

[Dootch]

Добрый день.
Собираю на ПЛИС Cyclone V E схему, которая измеряет разность времен прихода двух импульсов А и B. Длительность импульсов около 200 мкс, частота 1 Гц.
Время измеряется в единицах опорной частоты 100 МГц, подаваемой на счетчик. Схема приведена на рисунке.




Сигналы записи состояний счетчика в регистр я формирую синхронно с опорной частотой. Для того, чтобы состояние счетчика записывалось всегда корректно, как я понял необходимо указать компилятору что данные с счетчика на входе регистров должны быть стабильны к моменту прихода сигнала записи.
Вопрос как это сделать?
Возможно для корректной работы нужно изменить схему, но что-то никаких идей нет.