Вызов функции из interrupt [TIM2_OVF], неправильно обрабатывает данные Опции

[Savrik]

Есть обработчик прерывания(1 мс)

Код

interrupt [TIM2_OVF] void timer2_ovf_isr(void)
{
    // Reinitialize Timer 2 value
    TCNT2=0x83;  //сразу переинициализируем таймер
    // Place your code here
    timer++;
    if ((timer%2000) == 0)lcdUpdateStatus = 1;
    if (timer == 10000)
        {  
            timer = 0;
        }
}

и есть функция

Код

void systemCheck()
{
    uchar i;
    if (systemBusy)return;
    systemBusy = 1;
    ADMUX = ADC_U_MINUS;
    for (i = 0; i < 20; i++)
    {
        ADCSRA.6 = 1;    
        while(ADCSRA.6 != 0);    
    }    
    currSysStatus.Uminus = adc_data;  //currSysStatus глобальная структура
    ADMUX = ADC_U_PLUS;
    for (i = 0; i < 20; i++)
    {
        ADCSRA.6 = 1;    
        while(ADCSRA.6 != 0);    
    }    
    currSysStatus.Uplus = adc_data;
    selectInput(MULTIPLEX_L_TEMP);//выбираем соот. вход мультиплексора
    ADMUX = ADC_MULTIPLEX;
    for (i = 0; i < 20; i++)
    {
        ADCSRA.6 = 1;    
        while(ADCSRA.6 != 0);    
    }    
    currSysStatus.temp_L = adc_data;
    selectInput(MULTIPLEX_R_TEMP);    //выбираем соот. вход мультиплексора
    for (i = 0; i < 20; i++)
    {
        ADCSRA.6 = 1;    
        while(ADCSRA.6 != 0);    
    }    
    currSysStatus.temp_R = adc_data;
    systemBusy = 0;  
}

Если вызывать функцию из основного тела программы(напр., цикла в main() каждые 2000 мс), то все так, как надо

Umin 1023 Uplus 0, ACErr 0 Lalar 0 Ralar 0 Ltemp 275 Rtemp 254

но если я вызываю из обработчика прерывания каждые 2000, то валится какой-то бред..

Umin 259 Uplus 0, ACErr 0 Lalar 0 Ralar 0 Ltemp 259 Rtemp 259

Функция критична, так как в ней фактически реализован контроль за питанием усилителя.. вызывать из основного тела нереально ввиду того, что есть многоуровневое меню.. Что я не так делаю, и какие есть варианты.. мне нужно быть уверенным, что функция ТОЧНО вызовется через каждые 50 мс..