На сайте FTDI есть описание как это сделать:
http://ftdichip.com/Documents/AppNotes/AN232B-01_BitBang.pdf . В директории X:\altera\programmer\drivers\usb-blaster легко видеть соответствующие драйверы. Вопрос - кто-нибудь пытался собрать программатор на FTDI. Если да, то на каком чипе?