Да действительно. Наблюдается вот что.
Если открыть например IAR STM и сохранить этот проект, то в последующем от открывается и запуском файла проекта вместе с нужной средой. При этом все проекты IAR AVR теряют эту способность и наоборот. Если после сохранения STM или AVR проекта попытаться открыть противоположный путем запуска соответствующего файла проекта - теряются все настройки. А вот если запускать проект из предварительно открытой соответствующей среды то все работает. Странно - почему так. Ведь гораздо удобнее просто запустить файл проекта. Какая то странная недоработка IAR чтоли. Неужели у "них" все разработчики сидят только на каком то одном типе процессора? Естественно они этой проблемы не имеют

Спасибо за наставление на путь

Послесловие: работают также обе среды одновременно. Ну, по крайней мере, все открывается и компилируется в обеих средах без взаимных проблем. Отладчики пока в таком режиме не пробовал.