Проблемы при программировании STRATIX III SE110 по JTAG, Может кто сталкивался - помогите советом? Опции

[PPA]

Здравствуйте!
На плате стоят 2 стратикса 3 EP3S110F780. Загрузка ПЛИС предполагалась в режиме Active Serial Mode с ПЗУ, которые в свою очередь прошиваются через Flash Loader залитый в ПЛИСы через JTAG.
JTAG цепи раздельные. В схеме забыли подключить пин TRST на VCCPD, но внутри ПЛИС стоит 25кОм Pull-UP Resistor.
JTAG тесты работают без проблем. ID ПЛИС читается корректно.
При загрузке SOF файла в любой ПЛИС процесс доходит до 100% и пишет, что всё сконфигурировано, но на выходных пинах нет никаких признаков того, что ПЛИС загружен (Ножки не дергаются и на Conf_Done низкий уровень - хотя не знаю, должен ли он уходить в 1 при таком режиме программирования).
При прошивке конфигурационной ПЗУ процесс от запуска к запуску вылетает на разных процентах выполнения (вплоть до 97%), и выдается сообщение, что flashloader не загружен в ПЛИС.
При попытке загрузить SignalTap - говорит, что JTAG сконфигурировал ПЛИС, но при этом JTAG Invalid, т.е. не совпадает с сигналтаповским файлом.

Хотелось бы узнать мнение сообщества по проблеме.

P.S. Пытались подсовывать проволочку под корпус ПЛИС с целью замкнуть вывод TRST на 3,3В, но результат был такой же. С большой вероятностью мы всё-таки подавали 3,3В на этот пин.