Протокол управления программатором, Взаимодействие ПО на ПК и ПО в МК :) Опции

[Reanimator++]

Разработал проект настроечной машины для электронных компонентов.
Суть в том что компонент содержит микросхему, машина проводит ряд измерений и зашивает в микросхему калибровочные данные.
Машина содержит программное обеспечение на ПК и измерительные-программирующие платы под управлением МК.

Со временем количество поддерживаемых микросхем стало расти, ПО компьютера и плат обновляться.

Протокол общения ПК и платы делал по простому принципу - команда-исполнение-ответ.
Помимо общих команд управления платой, появлялись команды специфичные для каждого типа программируемых микросхем.
Протокол стал наполняться ими и становиться запутанным.

Особенно ситуацию усугубляло то что некоторые чипы поддерживают одинаковые протоколы с разным смысловым наполнением и соответственно со стороны ПК управляются одними командами.
У некоторых чипов наоборот от версии к версии протокол менялся (а в некоторых вообще были баги, требующие индивидуального подхода к отдельной ревизии чипа) при сохранении смыслового наполнения.

Появилась проблема проверки совместимости версий прошивки плат и версий ПО компьютера.
(где и какие поддерживаемые чипы, какие версии протоколов, баги и т.п.)
Начали появляться новые версии плат с измененным функционалом и другими поддерживаемыми чипами.


Хотелось бы организовать относительно простой и понятный протокол для управления всем этим безобразием.
Кто и как решает подобные проблемы? (когда задача одна - измерить и прошить - а способов ее исполнения множество).