Пришлось заглянуть в реф. мануал.
У F103 ноги USB никак специально конфигурировать не нужно, они сами включатся в нужный режим после включения USB.
А выключить USB можно битом в регистре USB_CNTR, после чего можно будет сконфигурировать освободившиеся ноги PA11 и PA12 в нужный режим.
Цитата
Bit 1 PDWN: Power down
This bit is used to completely switch off all USB-related analog parts if it is required to
completely disable the USB peripheral for any reason. When this bit is set, the USB
peripheral is disconnected from the transceivers and it cannot be used.
0: Exit Power Down.
1: Enter Power down mode.
Если мануал нам не врёт.
На реальном железе не проверял.
Russia est omnis divisa in partes octo.