Проблемы с программированием JTAG цепочки Опции

[Kattani]

Здравствуйте.
Имеется устройство содержащее несколько плат с плисами соединённые в цепочку следующим порядком: EPM1270 - EP1C6 - EP3C25 - EP3C25 - EP3C25.

У каждого циклона своя EPCS16, на выводах MSEL выставлен режим AS. Выводы эти подключены непосредственно к уровням, без резисторов.
Всё это дело нормально определялось квартусом. А потом стали вылезать неприятности.
Сначала был обнаружен интересный момент: если залит в EP1C6 прошивку, то все последующие попытки будь то автоопределение, либо прошивка других кристаллов оказывались бесполезными - цепочка не обнаруживалась. Хотя отладчик jtag её через раз видит. Если же сначала шить другие кристаллы, то никаких проблем, пока очередь не дойдёт до первого циклона. Приходится заливать *.sof, в противном случае замена соотвествующей EPCS-ки на чистую, т.к. возможность программирования теряется напрочь. При этом запрограммированный (неважно *.sof или *.jic) кристал EP1C6 вполне себе выполняет загруженный в него проект.
Второй случай с другим экземпляром данного устройства произошёл такой. Цепочка перестала определятся, отладчик изредка обнаруживал один из треьих циклонов. Виновником оказалась предпоследния плата с кристаллом EP3C25. У него все выводы (кроме питания и тех что имели внешнюю подвязку) находились, видимо, в 3-ей состоянии. На них было примерно от 0,5 до 1,5В. CONF_DONE - 0, nSTATUS - 0. Принудительный перевод nCONFIG в ноль ничего не давал. Всё питание на месте, не просажено и потребление в норме.
В чём может быть проблема?