Правильно ли я понимаю что внутренней флеши для пользовательской программы нет, после сброса "заводкой" загрузчик скопирует во внутреннюю RAM программу из spiFlash, USB и т.д. и передаст ей управление и уже эта программа должна проинициализировать SDRAM и скопировать туда основное приложение и запустить его?
Или если приложение маленькое то можно ограничиться одним (заводским) загрузчиком и внутренней RAM?

Именно так, кроме одной модели (ещё разрабатываемой), у которой вроде как 1 Мбайт флэша заявлен. Ну а нужно внешнее ОЗУ или нет, зависит от требуемых объёмов. Если внутреннего полностью хватает, зачем внешнее городить?

А как JTAGом код в SDRAM отлаживать? Допустим JTAG прошивку в SDRAM зальёт, но до этого контроллер SDRAM надо как-то инициализировать?

По идее, инициализировать можно скриптами, которые выполняются в процессе заливки. Ведь именно таким образом, например, инициализируется PLL, чтобы процессор (и его память) работал на адекватной скорости, а не на той, которая устанавливается сразу после сброса (она очень низкой может быть).

У LPC43xx есть возможнось грузится с внешней SPI флешки. Может кто подскажет список потдерживаемях микросхем или может я не то ищу?