Вроде бы получилось настроить среду и откомпилировать первый тестовый проект. Осталось разобраться с одной ошибкой, второй день ломаю голову, но найти причину не получается.
В результате компиляции, если судить по выводу в консоли, ошибок нет вообще никаких, но в окне Problems остаются записи вида:



Единственный способ устранить записи - это просто удалить их из этого окна по ПКМ.
После этого, сделав proj clean и последующий build all, видим, что записи больше не появляются, в консоли тоже нет ошибок.
Теперь вводим синтаксическую ошибку, например, в файл three.c.
Снова делаем build all и получаем вышеприведенную запись в окне Problems.
После этого синтаксическую ошибку убираем и делаем build all, но запись об ошибке в окне Problems не исчезает...
Так можно проделать с любым исходником, а окно Problems будет "накапливать" записи о соотв. ошибках.

По моему скромному мнению, запись должна исчезать, причем автоматом.
Ощущение, что это проблема eclipse - он не апдейтит "старые хвосты" по таким записям...

Просьба подсказать, что это может быть и каков результат в Indigo?

Прилагаю проект-заготовку и вывод лога в консоли для случая отсутствия ошибок...

Нажмите для просмотра прикрепленного файла Нажмите для просмотра прикрепленного файла

И у меня тоже - Juno + AvrGCC - та же история .

Проблема решается даунгрейдом на Indigo SR2. Там все в норме...