Подойдем ...чуть построже...
...прошу только учесть, что на адресном счетчике предлженном Вами, у Вас будет набегать дополнительное время из-за переноса...
...а для Ваших 17 разрядов 40МГц уже криминал, даже при использовании 74F... сделайте счетчик СИНХРОННЫЙ, тогда он будет работать точно.
Вообще то лучше опишите задачу... поточнее... думаю, что можно будет посоветовать...
Кроме "общей схемотехники" - самое главное - конструкция и собственно печатная плата... ... поехали дальше ... по "мелочам"...
12 бит - это такой АЦП, а сколько бит надо на самом деле...
...на выход АЦП обязательно поставьте буфер, что бы убрать помехи по проводам нагрузок и дополнительно сделайте эти связи (между АЦП и буфером) через резисторы...
ЗЕМЛИ (обратите - с БОЛЬШОЙ БУКВЫ) надо объединять правильно... плюс емкости, аналоговые цепи, блокировка... написал - шаманство, хотя, на самом деле нужен опыт, знание, умение...
Тактовый генератор... своя проблема. Для 40МГц такта для исследования 5МГц требуется малошумящий генератор (Кварцевый! на основной моде.) И через крошечную связь сразу на АЦП. Как только CLK проходит через вентиль, ТЕМ БОЛЕЕ CPLD и тем еще более FPGA про часть бит из 12 АЦП можно забыть... туда только счетчик адреса и логику обрамления памяти и интерфейс...
аналоговое питание, аналоговый буфер... входной усилитель... это своя песня...
Задача не такая простая, если ее делать правильно и аккуратно...
Посмотрите - примерно так у Вас должно получиться...
http://www.rudshel.ru/photos/dev_41_f2.jpg...у них на фотографии можно посмотреть достаточно подробно общую схемотехнику, даже некоторые номиналы и названия и разводку, хотя в основном догадки...