ФИгня какая-то - располагаю 2 SMD элемента на разных слоях. Как только они оказываются на одном уровне друг с другом - выдается ошибка - мол клиренс мал.
ПРичем не для всех компонентов, а лишь для некоторых. РАзницу между этими компонентами я не нашел.
Где отрегулировать правила, чтобы эта ошибка не выскакивала?

1 Скорее всего при перемешивании со слоя на слой не настроена была парность слоев.
2. ошибка в Footprint
Настроить парность слоев ==> Проверить Footprint --> обновить Footprint в PCB

а как ее настроить?

В настройках слоев внизу слева кнопка Layers Pairs

Mechanical layer pairs?

Ну добавил я 1 и 13 слои - ничего не изменилось...
Что значит проверить футпринт?

Приземленная проекция спирали галактики


Добавить мало. Нужно чтобы слои перепрыгивали на парный, при изменении стороны компонента.
Ну и при создании компонента нужно следить,Чтобы и сторона и слой БЫЛИ на нужной стороне и нужном слое

Я решительно не пойму, что с чем спаривать надо?
Зашел я в View Configuration, нажал на Layer pairs. У меня там появилапсь созданная пара из двух механических слоев. СЛои доступны только механические почему-то.

ЧТо касается футпринта - так любой SMD футпринт изначально в библиотеке располагается в слое TOP. А в Bottom он уже попадает в редакторе плат.

Нельзя ли пошагово объяснить, что делать?
Вот у меня 4 SMD элемента. Переношу два на противоположную сторону, располагаю друг под другом. Одна пара светится зеленым, другая нет. В чем будет отличие между двумя парами и что нужно сделать со светящимися элементами?

Та чего тут не понятно.
Как правило в библиотеке компонент рисуется со стороны TOP. (бывают исключения, но мозги пудрить не буду)
Все слои и так парные, кроме механических.
А вот если у компонента еще что либо нарисовано или находится на механическом слое--- ему нужно сопоставить второй- парный. Именно при переносе на другой сторону в PCB компонента на парный слой и перебрасывается соответствующая графика и тела

Да, но у меня механическая модель компонента, когда смотришь в 3D и так располагается на противоположном слое, располагается праввильно, только зеленая..

Смотрите модель, может она заходит "под плату"
смотрите правила, может зазор установлен больше, чем толщина платы
Вообще читайте, что пишет DRC-- тогда легче найти что, и с чем конфликтует

Нашел! Модели были кривые. У них ноль располагался в центре компонента и они "погружались" в футпринт и плату. Чем вызывали праведный гнев Altium.

Если парные слои назначать после того, как компоненты на противоположную сторону перенёс, то возможны глюки, т.к. после размещения на ПП, каждый футпринт становится самостоятельным и редактируется отдельно. Соответственно, если один футпринт перенесли на противоположный слой до назначения парных слоёв, то механические слои остаются без изменений, соответственно может произойти наложение, даже, если вы считаете, что компоненты на разных слоях.
Попробуйте перейти на слой Mechanical 1 и включить однослойный режим.

Ну второй пункт моего предположения "Смотрите модель, может она заходит "под плату""