Здравствуйте.

Имеется плата Trenz TE0603 с подключенным к ней немецким микромодулем TE0600 (на базе Spartan 6 xc6slx150).
Суть проблемы: к данной плате подключается другой модуль через стандартные разъёмы. Земля общая, но питание - раздельно.
При подключении модуля к данной плате Ethernet (на базе Marvell 88E1111, подключенной к Spartan
- находится на одной плате с ним) работает через раз. После отключения модуля проблема не исчезает.

Вот распиновка Ethernet (слевав - марвел, справа - ПЛИС):

PHY_RXD0 Y3
PHY_RXD1 W8
PHY_RXD2 W4
PHY_RXD3 U9
PHY_RXD4 V7
PHY_RXD5 V5
PHY_RXD6 W9
PHY_RXD7 U6
PHY_TXD0 AA18
PHY_TXD1 AB14
PHY_TXD2 AA16
PHY_TXD3 W14
PHY_TXD4 T16
PHY_TXD5 Y14
PHY_TXD6 V15
PHY_TXD7 AA14
PHY_TXEN AB16
PHY_TXCLK W12
PHY_GTXCLK R11
PHY_RXCLK Y11
PHY_RXER Y8
PHY_MDIO AB3
PHY_MDC AA2
PHY_INT AB2
PHY_RESET T15
PHY_LED_TX -
PHY_LED_RX -
PHY_L10 -
PHY_CRS T14
PHY_COL R13
PHY_RXDV Y4
PHY_TXER AB18

Проблема решена.

Это особенность чипа 88Е1111, при определённом стечении обстоятельств по включению питания
не вырабатывается CLK до подачи сброса. Данное поведение не стабильно и проявляется не на всех чипах.
Нужно проверить наличие сигнала CLK от PHY во время возникновения данной проблемы.
Если сигнал пропадает, подключите сигнал ETHERNET_PHY_RST_N к выходу LOCKED clock_generator.

Что вырабатывает клок 25 MHz (125 MHz) для 88Е1111?

Клок для данной микросхемы (25МГц) вырабатывается генератором CX07050T3. А уже с неё подаётся тактовый сигнал (тот, о котором шла речь - 125 МГц) на ПЛИС.