Девелопмент сервер - линукс, связан (комами/usb/ether) с девбордой. На сервере ваяете прикладухи кросстулами, закачиваете на девборду и
отлаживаете себе. В случае если очень уж нужен виндовз - пущаете его тут же - через вмтварь. У меня например только оркад и проверка
самописанных вин32 прог вызывает необходимость запуска виндов, кросстулы стоят под пальм/моторолла, ниос (квартус тоже под линуксом живет), авр, арм, вин32 (мингв) и texas c6x cgtools, т.е. имеется возможность без суеты ваять под все это с одинаковым набором программ (бинутилс/жсс/етц)
имеющим одинаковый интерфейс/версию/стуктуру проектов (немного texas подлатался в этом плане) и т.д. Если поставить оригинальные пакеты от производителей - можно задолбаться от их ненужного разнообразия. Также при желании есть matlab.
Вообще, наверное, это дело привычки, быстро к хорошему привыкаешь