Есть ли другие варианты кроме установки 4-х PDI разьёмов для программирования 4-х иксмег в одном изделии?

Я думаю, можно обойтись одним PDI-разъемом + коммутировать чем то линию RESET каждого МК. Например, джамперами.

Уже давно пользую связку 2-х мег по SPI + ресет от слэйва заводится на мастер контроллер.
При обновлении прошивки последнего он проверяет версию слэйва и апгрейдит его. Тоже самое, если он видит, что слэйв не отвечает.
В Вашем случае необходимо выделить одну из мег в качестве мастера и остальные шить через него. С PDI еще проще, всего 2 линии...

Программатор на мастере городить не хочется.


Думаю в качестве PDI разьёма в изделии поставить разьём с большим числом контактов чем у стандартного PDI.
А на дополнительные контакты вывести ресеты всех процессоров и коммутировать их переключателем на шлейфе-переходнике.
Как думаете мотут ли быть подводные камни в таком случае ?

Думаю нет.

Там кода самого программатора один листик
Зато потом плюсиков....

Программирование иксмеги другой иксмегой по PDI на один листик?
Какого формата листик? A0 ?
На чём текст? асм си?
Где бы на этот листик взглянуть?

На самом деле YAM прав. Я Вам говорю как автор программатора, который поддерживает программирование XMEGA по JTAG и PDI. Текста (на Си) ну может быть два листка формата А4 Кста, у Атмел есть аппноут, где все это описано даже, и, по моему, даже с исходниками. Так что есть резон подумать над таким вариантом. Он, конечно, объемистее в плане написания ПО для МК, плюс ПО для РС, плюс протокол, за то сильно экономит место на плате и рабочее время.
Вариант с джамперами/спец-разъемом простой и не требует разработки спец-ПО.
Выбирать все же Вам.