Есть задание спроектировать ЦФ. вопрос, как реализовать уже заданый алгоритм обработки сигнала? тоесть разносное уравнение? в контроллере или на железе?

Зависит от потребной тактовой частоты и точности.
Пока можно сказать одно: все операции деления в данной конкретной формуле легко заменяются операциями сдвига.