Схема и топология выполнены как рекомендовано в datasheet. Часы на FM31L278-G при этом отстают примерно на 10 сек за 2-е суток.
Если кварц подпаять непосредственно к ножкам микросхемы оторванным от дорожек платы, часы отстают примерно на 7 сек за 2-е суток.
Часовой кварц Jauch SMQ32SL.

Получается, калибровать надо. Тем более, что там очень удобно сделано: и выход CAL/PFO для измерения истинной частоты есть, и регистр (01h) для записи калибровки. При том, что калибровку можно делать встроенным микроконтроллером, если у него генератор достаточно стабильный (изначально и во времени/температуре).