Открываю в PartEditor свои компоненты а он те, что я создал, подсвечивает красным, те, что при помощи IODa были созданы, черным. В чем разница и как это поправить?

Красные компоненты не прошли верификацию, т.к. у них отсутствуют значения обязательных атрибутов (галочки групп верификации в Setup>Property_Verification).

Это те атрибуты, что в списке ComponentProperties в PartEditor стоят незаполненными и также красным подсвечены? Часть из них исчезает при снятиии галок в Setup>Property_Verification, но пару остаются. Как оставшиеся убрать?
И еще, непонятно как при стоящих галках в Setup>Property_Verification, у компонентов, созданных с помощью IOD, никакой красноты нет и список ComponentProperties в PartEditor пуст?

Уберите все галочки. Для этого:
- открыть *.cfg в текстовом редакторе и изменить DX на DC
- убрать галочки в Property_Verification
- вернуть DX обратно

А по другому нельзя? Например, в группе(Type IC), есть такой параметр Tech - он мне не нужен, но что я с ним не делаю в Tools>Property_Definition_Editor(кроме удаления), он всегда присуствует красным в списке Component Properties в PartEditor. Он, допустим мне не нужен, остальные пусть будут.
Вашим способом они удаляются а компоненты все одно красным светятся. Стоит по нему щелкнуть мышкой, черный становится. уйти в другой Partition, вернуться - опять красный.

1. Если сняты все галочки верификации, то нет обязательных атрибутов для верификации - они не будут автоматом появляться в PDB. Вы вольны в ручную добавить любой атрибут внутри PDB.
2. Есть пункт Verify_All_Entries, черноту надо зафиксировать - File>Save.