Как в PCAD2006 сделать подобное http://www.pselectro.ru/upload/u0480.jpg ?

Нарисовать на слое Board?

PS На таких внутренних углах можно размещать не металлизированное отверстие, притапливая его в глубь платы на величину погрешностей, что бы всю фрезеровку по контуру можно было делать одной фрезой 2мм или 3мм.

А вопрос в чём? Две прямых линии под углом в 90 градусов. Между ними дуга в 180 градусов.
Рисуете и составляете контур.

Инструментом PlaceBoardCutout рисуете контур прямоугольного выреза в слое Board, например.
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
Выделяем контур и жмем ПКМ в месте, где должна кончаться дуга. Добавляете вершину, как показано на рисунке снизу.
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
Преобразуем сегмент в дугу - наводим мышь на середину сегмента, жмем ПКМ:
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
Указываем угол дуги - 180 градусов (или любое другое нужное значение):
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
Если получилось не в ту сторону, можно сделать по новому, только с отрицательным углом, а можно перевернуть дугу:
Нажмите для просмотра прикрепленного файла
Получится именно то, что и было нужно:
Нажмите для просмотра прикрепленного файла