Добрый день! Проектирую микроконтроллерное ЗУ для NiMH аккумуляторов. Подскажите, пожалуйста, возможно ли заряжать 4 последовательно включенных элемента 1.25В (каждый) используя входное напряжение 5В, применив, например, buck-boost схемотехнику?

Да, если после бустера включить соотв. ИС зарядного устройства. А так пяти вольт для четырех аккумуляторов мало. Полностью заряженный аккумулятор может выдать до 1.8В, если мне память не изменяет.
Вот только зачем в этом деле МК ?

А, в чем вопрос?
Для зарядки банки Вам потребуется источник с напряжением более 5 В (см. напряжение макс. заряженного акк.).
Как вы его получите (на какой схемотехнике), вроде не важно.

Главное, соблюсти режим заряда, и вовремя отключить зарядку при превышении уровня 1.4V на банку. Конечно в такой схеме какие то банки будут перезаряжаться, а какие то недозаряжаться, но тут есть выход. Сначала заряжать большим током 0.5..1С, а при достижении 70% заряда дозаряжать маленьким током в течение 12..16 часов 0.05...0.1С. В режиме заряда малым током NiMH невозможно перезарядить, и тогда можно практически полностью зарядить все банки, независимо от индивидуальных особенностей.