Столкнулся с непонятной мне проблемой. Есть проект выполненный на attiny88 в Atmel Studio 6. Прога должна выполнять мигание светодиодом раз в секунду, после 60 секунд должен загореться второй светодиод. И реализовать решил это двумя способами. Первый способ: проверка флага совпадения таймера каждую миллисекунду. Если было совпадение выполнить условие. Диод моргает, но гораздо чаще чем раз секунду. Второй способ это через прерывание: программа переходит к обработке прерывания, но диод моргает гораздо медленнее. Я прикрепил архив с проектом в Студии и схемой в Протеусе. Нажмите для просмотра прикрепленного файла

Первый вопрос: вы отключили бит CKDIV8 ?

Я фьюз биты не трогаю. Я в самом начале проги выставил 8МГц (#define F_CPU 8E6), а также в окне Processor View строка Frequency 8,000MHz. Да и где в Atmel Studio можно выставить фьюз биты???