Здравствуйте. Сделал автонумерацию, потом ещё раз пришлось сделать. В результате (См. картинку) некоторые компоненты стали выглядеть как на картинке- J10(J8). При компиляции альтиум ругается мол у меня два компонента с именем J8. Пробовал сбрасывать дезигнейторы-не помогло. Как быть? А навигатор думает что элемент имеет дизигнатор J8

Скомпилируйте проект и СОХРАНИТЕ. То, что в скобках-- пропадет (это для вас подсказка, как они обозначались ранее. Ни на что не влияет.)
То что у вас 2 компонента J8: Ищите на схеме. Они там есть и имеют флаг Lock для Designator. Поэтому их и не переименовывает

Пришлось удалить элементы и вставить их снова

"мы не ищем легких путей"?

Не обязательно. Если коннектор составной, а части взяты с разных библиотек, или на разной стадии редактирования в библиотеке то удаление и вставка один из самых быстрых и понятных (но не единственны) способов.
Может у автора, такой случай