Нагуглил три мнения по настройке неиспользуемых выводов в STM32:
1. Аналоговый вход
2. Выход = 0.
3. Отключить тактирование порта.

Какой из вариантов лучше с учетом помехоустойчивости?
Спасибо.

Какая уж тут помехоустойчивость, если выводы не используются?
Может быть, с точки зрения минимального потребления тока?

Классический вопрос порождает классический ответ:

Вывод установить в состояние "дискретный выход"
и Установить любое состояние (1 или 0) или то, которое является малопотребляющим для данной структуры (обычно устанавливают "0", как бы увеличивая площадь подключенного к GND пространства платы).

Дело в том, что когда-то давно слышал мнение, мол болтающиеся выводы могут наводить помеху на шину тактирования в самом мк и всегда настраивал unused pins на выход с лог.0.
Однако сейчас завязалась дискуссия с коллегой в необходимости данной операции, поэтому и создал тему, чтобы услышать мнение опытных инженеров.
Кстати, эту тему также затрагивают на многих англоязычных форумах и нигде нет однозначного ответа.
Еще знакомый рассказывал, что на AVR болтающиеся пины значительно увеличивали потребление мк.

На любой КМОП-микросхеме болтающиеся ВХоды приводят к увеличению потребления... Из-за сквозняков на входе

Лучше всего конфигурировать как входы с подтяжкой, тогда если при монтаже сопля случайно коротнёт ножки на землю/питание/друг друга, ничего страшного не будет. Ну или как выход с определённым уровнем